资料汇编:

新冠病毒变异编号和命名

Q

新冠病毒变异是怎样编号和命名的? “Delta”, "B.1.617.2", "G/452R.V3", "21A/S:478K"是同一个变异吗?

✍: Guest

A

“Delta”, "B.1.617.2", "G/452R.V3", "21A/S:478K"是一个新冠病毒变异 不同的编号和命名?

新冠病毒变异有四种常用编号和命名系统:“Pango”, “GISAID”, “Nextstrain”,”WHO“, 其中“Pango”编号最为普及。

“PANGO (Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak)“ - PANGO编号前面的英文字母代表属于某一个支系 , 后面的点和数字代表来源于前面支系的第几个子代分支。 如以B.1.1.7为例,B.1.1.7是B.1.1支系的第七个子代支系, C.1是C支系的第一个子代分支。

Pango命名法将谱系名称限制在最多四个层次的祖先, 以确保谱系名称不会过长,当某一个支系后面的数字超过3个时, 将产生一个新的字母支系。在巴西传播的关切变异株被称为P.1,而不是B.1.1.28.1。

Pango命名能清楚表示出该突变株在进化上位置,以及和其他突变株的亲缘关系的远近。

“GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data)“ - GISAID编号是根据病毒基因组的进化距离来命名的。 2020年2月携带S-D614G突变的毒株在全球迅速传播,这群变异株就被命名为G。 大的支系可以继续向下划分,如G支系后续又分支为GH,GR支系,支系后面可以标注关键的突变位点。 如伦敦突变株,在GISAID命名系统中为GR/501Y.V1。

“Nextstrain” - Nextstrain命名是以年份开头,后续依次按照字母顺序来命名变异株, 如伦敦突变株,在Nextstrain命名规则中命名为“20I(V1)”。 Nextrain定义一个新的支系需要满足以下3个条件之一:

  • 在全球流行超过2个月且比例超过本时期流行株总数的20%以上
  • 在某个地区流行超过2个月且比例高于本地区同时期流行毒株的30%
  • 出现引起公共卫生风险的变异

“WHO (World Health Organization)” - 为了便于公众对这些变异株的讨论和认识, WHO推荐使用希腊字母(Alpha, Beta, Delta, Gamma)来命名重要毒株。 依据这些变异株的传播力、致病力不同,将其 分为“关切变异株”(variant of concern, VOC) 和“关注变异株”(variant of interest, VOI)。

关注变异株(VOC)变异毒株的公共卫生风险更高,更受大众关注。 关注变异株必须满足以下3个条件之一:

  • 传播能力增强或者流行特点出现不良方向的改变
  • 毒力增强或者临床致病性增加
  • 毒株的变异使公共卫生,社会干预措施,或现有诊断、疫苗、治疗方法的有效性降低。

 

新冠病毒变异一览表

新冠病毒变异毒株

新冠病毒其它相关知识

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2021-08-07, 303👍, 0💬